我区伊犁、塔城地区的天山野果林是中亚天山野果林的重要组成部分，也是研究世界温带果树遗传多样性和基因进化的重要种质基因库。其分布以巩留、新源的野生塞威士苹果、霍城大西沟的野生樱桃李、巩留县吾吐布拉克沟的野核桃、裕民县巴尔鲁克山的野生巴旦杏为代表。
这一地区除了丰富的野生果树资源外，还蕴藏着丰富的野生药材、蔬菜、观赏植物和食用菌资源，伊犁野果林资源不仅对于当地保护生态环境特别是水土保持以减少山体滑坡、泥石流等地质灾害的发生以及利用野生果树开发新产品发展区域经济意义重大，并且其学术研究价值已经引起了国内外学者的广泛关注。但是目前这些资源正面临着前所未有的生存危机，对其实施保护已刻不容缓。
1959年统计资料表明，当时伊犁地区野苹果、野杏的总面积为9446 hm2，时隔半个世纪，当前野果林面积据初步测算不足6000 hm2。根据当年参加1959年调查的研究野果林多年的资深专家林培钧先生估计，目前的野果林实际分布面积只有50年前的30%左右，以大西沟为例，50年代调查时，野苹果在沟口处即有成片分布，现在，只有深入沟中14km处才有野果林分布。野果林面积锐减后导致了严重的生态效应，当年的清水河已成一条今天的浊水沟了，失去植被保护的河岸被泥石流切割成悬崖，进沟者已无路可走。位于塔城中哈边界巴尔鲁克山的野生巴旦林更是在劫难逃，2003从哈国来的一场大火使其近于毁灭。
由于缺乏有效的防治，严重的病害和虫害威胁着其伊犁野果林的生存。2004年，严重的樱桃李烂果病、杏细菌性穿孔病几乎使大西沟的这二种野果树绝产。更为严重的是野生野苹果正面临着苹果小几丁虫引发的灭顶之灾。全州7万亩野苹果林中，已有6万亩不同程度发病，只有巩留县核桃沟1万亩未发现病情。发人深思的是在伊犁野苹果中发现的小吉丁虫是人为引种不当酿成的恶果，1992年新源县肖尔布拉克农场从山东烟台引来一批苹果苗木，次年大量死亡，经检验为国际检疫对象苹果小吉丁虫所致。以后几年，这一虫害迅速从新源扩大到全州，从栽培苹果蔓延到野苹果。自治区领导王乐泉、熊辉银多次批示对伊犁小吉丁虫进行根本的防治。由于野生果树空间分布的特殊性和小吉丁虫本身的顽固性，目前采取的剪枝焚烧、喷雾打药、打孔注药等方法均不能收到理想的防治结果。
野生果树作为一个自然的植物群落，有着一套完整的繁育体系来维持种群的生生不息，如野苹果主要以根蘖繁殖为主，而野杏则以种子实生繁殖为主。由于在野果林分布区过度的放牧和毁林造田，以及无节制的旅游开发，野果林固有的繁育体系正在遭到破坏，结果导致野果林种群中的不同树龄的林相结构发生改变，在野果林中难以见到新生的更新树。笔者2005年5月初在巩留县库尔德宁定位观察野果林时，发现在老树周围有大量的苹果根蘖苗和杏实生苗发出，待到8月再度观察时，这些幼苗连同周围的杂草均被当地牧民作为牧草收割殆尽。在成片野果林被毁地块，当地牧民则趁机种上油葵等农作物。
1．将伊犁野果林资源的研究纳入到“国家自然科技资源平台建设”的框架内
当前，国家科技部、发改委等多部委联合正在实施“国家自然科技资源平台建设”项目，许多农作物、牧草、林木等都纳入了这一项目的框架内。鉴于伊犁天山野果林资源的特殊性和重要性以及亟待保护的迫切性，建议自治区政府组织有关农业、林业的主管和科研部以及伊犁州相关单位联合向国家申报“天山野果林资源工作共享平台建设”项目，将天山野果林的研究与保护纳入到“国家自然科技资源平台建设”项目框架内。在项目支持下，对天山野果林资源进行种群遗传结构、病虫害综合防治等重大课题联合攻关，为政府进一步制定有效的保护策略提供科学依据，同时推动我国野生果树种质资源的信息与实物共享。另外，在原伊犁州天山野果林研究与发展中心的基础上，建立天山野果林资源共享平台――那拉提工作站，为开展野果林的长期综合研究提供一个野外工作平台。笔者认为，自上世纪80年代以来，伊犁州园艺研究所、中国科学院新疆生态地理研究所、新疆农业大学、日本国静冈大学、山东农业大学等单位已经围绕天山野果林做了很好的基础性研究工作，并且建立了很好的合作关系，联合申报这一课题的条件已经成熟。
在野果林保护区划上，可采纳林培钧先生的建议，即结合野果林生态环境旅游区的规划，根据野果林在伊犁河谷的分布位置，规划东、西两个天山野果林生态环境旅游区，东部旅游区位于那拉提北坡，东起新源县的那拉提，经交吾托海至巩留县的莫合尔和吉尔格郎，西部旅游区位于婆罗科努山南坡，东起霍城县的果子沟，经小东沟、大东沟、小西沟止于大西沟。在野果林的具体保护措施和操作规程方面，应按行政区划分期、分批、分片进行保护、建设和管理。根据不同的地理环境条件。选择降水多、土层厚、地形开阔、便于封山管理的野果林区，作为保护和建设的试点，树立样板，取得经验后逐步扩大保护和建设范围。
切实建立健全病虫检疫体系，加强虫情、病情的调查监测，加大检疫执法力度，严防外来有害生物的侵入，严厉禁止从疫区调运苗木、种子、产品等材料，防止小吉丁虫扩散、蔓延。制定科学的长远规划，开展系统防治，积极开展在野果林特殊生境条件下苹果小吉丁虫的有效防治办法。同时建立相应的森林防火预警机制，避免重演塔城野巴旦的悲剧。
